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卓越平台 | 发掘蛋白可开发性的宝藏路径:in-silico预测与表征验证

发布日期:2023-06-19

药物可开发性研究是一种风险评估和风险缓解措施,旨在将候选物高概率地开发成临床医学中可用的药物。在此开发过程中,为了高效低成本筛选出低风险候选分子进入CMC开发阶段,可以利用多信息平台In-silico预测分析,以极低的成本获取靶蛋白结构、物理、化学性质和潜在风险信息,设计针对性的表征实验加以验证,确保以合理的成本和时间线内顺利通过化学、生产和控制流程(CMC)。

本文将简单展示行业内通用可开发性策略,结合乐竞网页版in-silico分析平台,对创新蛋白分子可开发性评估中的具体工作梳理一些思路。

In-silico预测数据全流程支持药物可开发性研究

In-silico使用分子信息学对候选分子的物理化学属性、结构、聚集倾向、翻译后修饰、稳定性和免疫原性的预测信息,能够有效对候选药物分子进行排序,筛选,定向优化改造,提供潜在风险的早期提示,帮助我们及时调整开发策略,如调整上下游工艺和制剂配方开发,以解决潜在问题。



In-silico分析助力分子筛选和优化

In-silico分析基本流程

基于序列分析和3D空间结构测量,能够获得蛋白分子量、等电点、消光系数、二硫键、游离巯基、糖基化等信息,进一步对潜在风险翻译后修饰、分子完整性、聚集性、疏水性等属性进行预测。3D可视化能够加深对功能位点和作用机制的深刻理解,结合平台经验,进行风险识别和应对策略评估,此外结构和分子背景的全面科学理解,对上下游工艺,分析方法,制剂开发能提供有力参考。



乐竞网页版in-silico分析流程



乐竞网页版in-silico常用工具

表征验证平台
汉腾理化分析和生化分析平台具备成熟的药物可开发性研究策略和分析评估经验,利用in-silico对候选物的属性预测,针对性设计关键表征分析实验,能够低成本、高效率以及高准确度地对候选分子的可开发性潜力进行评估。


乐竞网页版in-silico数据验证方案

IgM 开发实例
IgM是人体第一道天然免疫屏障中关键的免疫球蛋白,能够结合补体,杀菌,溶菌,中和病毒对抗病原体入侵。天然IgM分子量巨大,血清中以900KD大小的五聚体形式存在,具有重组表达量低,溶解度低,稳定性差等历史难题,但乐竞网页版IgMax平台成功克服以上困难,已协助多个客户完成IND研究。

在此之前汉腾分析团队对已对IgM的聚集体形式、二硫键、游离巯基、氨基酸序列、翻译后修饰、N-糖基化位点、假病毒中和活性等进行in-silico预测和全面的表征验证工作,获得其五聚体含J链的构型、98对二硫键、2个游离巯基、51个N-糖位点、各位点优势糖型和空间功能的全面属性揭示。大大加快了IgM在生物制药领域的应用进度。


IgM模式图




in-silico自由巯基的3D预测和表征验证方案



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